您好，坐标系的投影转换在不同椭球的局部球面上是会存在数学上的参数换算误差的，但是这种数学性误差是很小很小的，而且是有矫正的，即转换转回过程点和目标点是不动的。
如果您投影转换的过程正确，因此建议您对原地图集数据集的坐标系及其参数设置是否正确进行确认。
对于您数据当前最终情况，是可以用地理配准解决的，但是您的数据是因坐标系设置不对导致的误差，并不建议您使用地理配准来进行解决。您使用正确的坐标系设置，最后可以得到全数据正确精准的转换后结构，使用地理配准后的数据可以矫正偏移，但是数据区域的精准取决于您的配准点位的数量与正确性，因此还是建议您正常数据处理的流程，设置正确的坐标系来实习，若坐标系信息丢失实在无法确认在使用配准。
希望可以帮助到您！
